Tematické zaměření a hlavního cíle Národního centra pro energetiku II znázorňuje maticová struktura, ve které témata v horizontální rovině nesou výstupy aplikovaného výzkumu, a témata ve vertikální rovině pak obsahují analýzu dopadu implementace výstupů VaV na oblast sociální a ekonomickou s respektováním pravidel taxonomie a zásady "významně nepoškozovat".
Každé z horizontálních témat - aplikačních segmentů je vedeno odborných garantem zodpovědným za tematickou náplň v souladu s globálním cílem NCE II.
